一宗一派の宗務を統括する寺院。江戸時代に宗流制度が確立してから定められた。総本山は本山の上にあって一宗・一派を統括する寺。大本山は総本山の下にあって、所属の寺院を統括する。一般的に△ 法相宗～奈良興福寺△華厳宗～奈良東大寺△律宗～奈良唐招提寺△天台宗～比叡山延暦寺△真言宗～高野山金剛峯寺△浄土宗～京都知恩院△臨済宗～京都妙心寺・大徳寺△浄土真宗（本願寺派）～京都西本願寺△浄土真宗（大谷派）～京都東本願寺△曹洞宗～越前永平寺△黄檗宗～宇治万福寺△日蓮宗～身延久遠寺△時宗～藤沢浄光寺△日蓮正宗～富士大石寺といわれる。